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环状DNA测序工具面世 澳门文证新闻资讯网

根据物理学家组织网络5月14日的一份报告,加拿大阿尔伯塔大学的生物学家发明了一种新的工具来对环状DNA进行测序,这将为科学家提供更丰富、更准确的数据,并有望促进对病毒、农业甚至癌症的研究。

这个叫做“苹果酒序列”的工具,使用了被称为“PacBio”的DNA测序技术。研究人员现在已经将它发布在互联网上,供其他科学家分析DNA序列。

这项研究的主要作者和博士后研究员德国梅塔说:“有了苹果酒序列,我们可以理解人类和植物细胞中神秘的环状DNA的功能。”

研究人员解释说,环状DNA在细菌和病毒基因组中非常常见。最近,科学家在人类和植物细胞核中发现了环状DNA,称之为染色体外环状DNA。这种鲜为人知的环状DNA也经常在癌细胞中发现,甚至可能与其快速繁殖的能力有关。

研究人员以前已经开始研究eccDNA在癌症中的作用,但是由于缺乏有效的研究和测序方法,这种研究进展缓慢。

梅塔说:“有鉴于此,我们设计了一种新的分子生物学方法和一种新的生物信息学算法,以最终获得完整的椭圆曲线DNA序列。我们的方法可以完全测序这些分子,并为我们和其他研究人员提供一个新工具,以更好地了解它们在细胞中的实际作用。”

梅塔指出,新工具可能对农业科学家特别有用,因为许多感染作物的病毒都有环状DNA。例如,他说:“在肯尼亚的一次田间试验中,我们使用了早期版本的苹果酒-Seq来帮助研究基因工程作物对抗环状DNA病毒的有效性。”(记者刘霞)

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